Program 5th EBM

Wednesday June 27

Chordate Evolution session

Chairman : Patrick Lemaire

9h00 : The amphioxus genome has both archetypal and derived features.J. Garcia-Fernandez, C. Minguillon, D..Ferrier, E. Benito, J. Gardenyes, A. Rosanas, E.Serra, E. Gendive, M. Illas.

9h30 : Gene evolution at the transition from invertebrates to vertebrates as illustrated through the amphioxus genes. G. Panopoulou , S. Hennig , A. Krause, R. Herwig , M. Vingron & H.Lehrach

10h00 : Large scale amphioxus genome analysis and vertebrate evolution. L. Abi Rached, A. Gilles, H. Hinoko,

P. Pontarotti & T. Shiina

11h00: Gene duplication and the evolution of vertebrate genomes. V. Laudet, M. Robinson-Rechavi, H. Escriva& O. Marchand.

11h30 : Repetitive sequences in the Amphioxus genome. R. Albalat, C. Cañestro, D. Dalfó, A. Matínez-Mir, J.Permanyer, L. Godoy & R. Gonzàlez-Duarte.

12h00 : Early emergence of a dopamine D1-like receptor in the lancelet, Branchiostoma floridaeS. Candiani, P. Castagnola, D. Oliveri, A.Augello & M.Pestarino.

Chairman : Georgia Panopoulou

14h15 : The Retinoic Acid Signaling Pathway regulates anterior/posterior patterning in the nerve cord and pharynx of Amphioxus, a Chordate Lacking Neural Crest. H. Escriva, N. D. Holland , V. Laudet & L. Holland

14h35 : Isolation and expression of forkhead genes in a basal chordate (Branchiostoma floridae ).F. Mazet & S.M. Shimeld.

15h15 : A single TRK neurotrophic receptor in Amphioxus : insights into theevolution of neuronal survival signalling systems.E. Benito, J. Egea , J..X. Comella & J. Garcia-Fernández.

15h45-16h45 :Coffee break and poster session

16h45 : The BMP/CHORDIN antagonism controls sensory pigment cell specification and differentiation in the ascidian embryo. S. Darras , & H. Nishida.

17h15 :Specification of anterior neural fates in the ascidian, Ciona intestinalis. C. Hudson, D. Ferrier, V. Bertrand, D. Caillol, P. W.H. Holland & P. Lemaire.

17h45 : Evo-Devo-study of the function of the Brachyury proteins. S. Marcellini & P. Lemaire.

Thursday June 28

Paleobiochemistry session

Chairman : Michèle Dufrenne

9h00 : Etude de la population égyptienne de Gurna. A. Stevanovitch, A. Gilles, J.-L. Spadoni & E. Beraud-Colomb

9h30 : Ancient DNA and pleistocene evolution of european bears. L. Orlando, A. Thenot, M. Patou-Mathis, M. Philippe, & C. Hänni.

10h00 : Molecular clock and the genetic incidence of climate oscillations : insights from an extinct species, the cave bear (Ursus spelaeus). L. Orlando, A. Thenot, M. Patou-Mathis, M. Otte & C. Hänni.

10h30 – 11h30 : Coffee break and poster session

Bacterial and zooplanctonic evolution session

11h30 : A minimal model to explain certain features of bacterialevolution in laboratory experiments. L. Acerenza and M. Graña.

12h00 : Description d’un cas d’asymétrie fluctuante chez le Copépode Paracalanus sp. S. Richard, J.-P. Grillasca & J.-L. Jamet

12h00 – 14h00 : Lunch

Epistemology session

Cette session a été organisée de facon indépendante par M C Maurel et B Brun dans le cadre des réunions évolutions biologiques

Chairman : Marie-Christine

14h00 : Comment la nouveauté est-elle possible ? Un exemple, les origines de la vie. M. C. Maurel

14h20 : Les mille et une manières de muter. J. Ninio

14h40 : Ni Dieu, ni gène. P. Sonigo

15h00 : Le paradoxe de la sélection d’une fertilité réduite. G. Neve

15h20 : Le progrès dans l’évolution. B. Brun

15h40 : L’évolution du codage de l’espace : le langage apporte-t-il un nouveau traitement ?C. Thinus-Blanc

16h00 : Qu’est-ce que le nouveau pour l’animal ? B. Poucet

16h30 : Table ronde : Nouveauté et Evolution, apparition du nouveau dans l’histoire du vivant

Friday June 29

Molecular evolution session

Chairman : Pierre Sonigo

9h00 : Les covarions en évolution moléculaire: modélisation, détection. N. Galtier

9h30 : Phylogenetics analysis of paralogs.A. Gilles, P.Pontarotti & L. Abi Rached.

10h00 : Molecular evolution of snake venom toxic enzymes. V. Choumet, L. de Haro, A.Robbe-Vincent, B. Saliou, B. Vally & C. Bon.

10h30 – 11h00 :Coffee break

11h00 : Expression pattern of an Otx5-related gene in the dogfish Scyliorhinus canicula . Evolutionary Implications. T. Sauka Spengler, B. Baratte, & S. Mazan.

11h30 : The MHC Class I region of Fugu rubripes : an evolutionary perspective. M.S. Clark

12h00 : Isochore organization of mammalian genomes : selection or neutral evolution? D. Mouchiroud & L. Duret.

12h30 – 14h : Lunch

Chairman : Pierre Netter

14h30 : Selfish DNA Parasitizing Protein-Coding Genes of Rickettsia. H. Ogata, S. Audic, J.M. Claverie

15h00 : Gene duplications in regions of the pufferfish (Fugu rubripes) genome sharing synteny with human 20q. S.F. Smith & G. Elgar

15h30 – 16h :Coffee break

16h00 : Reducing the complexity of multigenic diseases by paralogy and synteny. J. Berry, S. Gaudieri, P. R. Carnegie & R. L. Dawkins.

16h30 : Base de données pour la prédiction et la cartographie des régions de paralogie chez les vertébrés. M. Leveugle, D. Birnbaum & F. Coulier.

17h00 : Discussion and conclusion

Présentations affichées – Poster sessions

Biogeography of the evolution and genus Avicennia Anne Bousquet-Mélou and Stephan Maumont

Large scale comparison of metazoan genomes: search for Human/Drosophila conserved syntenies by bioinformatics analysis. Etienne Danchin, Laurent Abi Rached , André Gilles et Pierre Pontarotti.

Description d’un cas d’asymétrie fluctuante chez le Copépode Paracalanus sp. Simone Richard, Joël-P Grillasca et Jean-Louis Jamet

DIMBO : banque de diversité mitochondriale bovine Jean-Louis Spadoni, Alain Stevanovitch et Éliane Beraud-Colomb

CpG islands in amphioxus genome Pierre Pontarotti , Laurent Abi Rached

Chaetognathe a new model to understand metazoan physiology development and evolution Xavier Caubit , Yvan Perez , Daniel Papillon, Jean Paul Casanova

Genetic analysis of host mechanism controlling endogenous murine leukemia virus gene expression. Luc Reininger

Characterization of a microsomal retinol dehydrogenase gene from amphioxus: retinoid metabolism before vertebrates Diana Dalfó, Ricard Albalat and Roser Gonzàlez-Duarte

Endogenous ß-galactosidase activity in amphioxus: a useful histochemical marker for the digestive system Cristian Cañestro, Ricard Albalat, Hector Escrivà and Roser Gonzàlez-Duarte

Expression and evolution of Fyn isoforms C Picard, A Gilles, D Olive, Y Collette